Bioinformatica
(Laurea Magistrale in Informatica)
Anno Accademico 2010-2011
Esami:
- Per la preparazione dell'esame gli studenti devono scegliere di analizzare
un articolo scientifico pubblicato sulle seguenti riviste (nelle annate dal 2000
in poi):
Genome biology, Bioinformatics, Briefing in Bioinformatics, Omics, Bms Bioinformatics
Docenti:
Orario del corso:
- Il corso si tiene presso il Dipartimento di Informatica, nel primo semestre.
- L'orario è riportato in bacheca e on-line al link
Orari delle lezioni.
-
- : (eventuali cambi di orario)
- Le lezioni dei giorni martedì 5 e 12 ottobre 2010 non si svolgeranno causa impegni del docente.
Programma del corso (provvisorio):
- Introduzione alla biologia molecolare
- Introduzione alla biologia computazionale
- Panoramica dei problemi aperti
- L'allineamento di sequenze
- L'allineamento multiplo di sequenze
- La ricerca di omologie e l'estrazione di motifs
- Algoritmi per la predizione della struttura delle proteine
- Algoritmi di analisi di dati di microarray
- Algoritmi per la costruzione di alberi filogenetici
- Next Generation Sequencing: problemi e algoritmi
- Gene Networks: algoritmi per la costruzione e l'inferenza
- Modelli per l'analisi di pathway metabolici
Materiale usato a lezione:
Materiale delle esercitazioni in laboratorio:
Libri di testo e consultazione:
- G. Valle, M. Helmer Citterich, M. Attimonelli, G. Pesole: Introduzione alla Bioinformatica, Zanichelli, 2003.
- A. Lesk: Introduzione alla Bioinformatica, McGraw-Hill, 2004.
|